RESUMO
DNA methylation is essential in X chromosome inactivation and genomic imprinting, maintaining repression of XIST in the active X chromosome and monoallelic repression of imprinted genes. Disruption of the DNA methyltransferase genes DNMT1 and DNMT3B in the HCT116 cell line (DKO cells) leads to global DNA hypomethylation and biallelic expression of the imprinted gene IGF2 but does not lead to reactivation of XIST expression, suggesting that XIST repression is due to a more stable epigenetic mark than imprinting. To test this hypothesis, we induced acute hypomethylation in HCT116 cells by 5-aza-2′-deoxycytidine (5-aza-CdR) treatment (HCT116-5-aza-CdR) and compared that to DKO cells, evaluating DNA methylation by microarray and monitoring the expression of XIST and imprinted genes IGF2, H19, and PEG10. Whereas imprinted genes showed biallelic expression in HCT116-5-aza-CdR and DKO cells, the XIST locus was hypomethylated and weakly expressed only under acute hypomethylation conditions, indicating the importance of XIST repression in the active X to cell survival. Given that DNMT3A is the only active DNMT in DKO cells, it may be responsible for ensuring the repression of XIST in those cells. Taken together, our data suggest that XIST repression is more tightly controlled than genomic imprinting and, at least in part, is due to DNMT3A.
Assuntos
Humanos , Metilação de DNA/genética , Repressão Epigenética/genética , Genoma Humano , Genoma/genética , Impressão Genômica/genética , Fator de Crescimento Insulin-Like II/genética , RNA Longo não Codificante/genética , Azacitidina/administração & dosagem , Azacitidina/análogos & derivados , /genética , Metilação de DNA/efeitos dos fármacos , Técnicas de Inativação de Genes , Genoma Humano/efeitos dos fármacos , Hibridização in Situ Fluorescente/métodos , Análise em Microsséries , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Proteínas/metabolismo , RNA Longo não Codificante/metabolismo , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real/métodos , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa/métodosRESUMO
The aim of this study was to evaluate different mating strategies among endogamic strains to create F1 populations of mice, minimising the effect of inbreeding depression on somatic development and embryo yield. Females from the strains Swiss, CBA and C57Bl/6 were divided in nine experimental mate arrangements. The total numbers of pups born alive per dam and somatic development, estimated by weighing and measuring the crown-rump length, were recorded. Superovulation response was evaluated in outbreed females. Litter size differed among endogamic dams, irrespective of the sire. Somatic development results suggest heterosis and imprinting phenomena, once a differential parental effect was demonstrated. There was no difference in corpora lutea, ova or embryos recovered (P > 0.05), but recovery and viability rates differ among F1 groups (P < 0.05). The association of dam prolificity with somatic development and superovulation response of the pups should be considered for experimental F1 populations establishment. The use of outbreed animals, however, did not reduce response variability to hormone treatment.
Objetivou-se neste estudo avaliar diferentes estratégias de cruzamento entre linhagens endogâmicas para a formação de populações de camundongos F1, minimizando o efeito da depressão por endogamia nos resultados de desenvolvimento somático e produção de embriões. Fêmeas das linhagens Swiss, CBA e C57Bl/6, foram distribuídas em nove possíveis cruzamentos. Foram registrados o número de filhotes nascidos vivos por matriz e o desenvolvimento somático dos mesmos, mensurado pelo peso e comprimento. A resposta superovulatória foi avaliada nas fêmeas cruzadas. O tamanho das ninhadas diferiu entre as linhagens das matrizes, de forma independente da linhagem dos reprodutores. Os resultados do desenvolvimento somático sugerem a ocorrência de heterose e imprinting, uma vez que foi demonstrado um efeito parental diferenciado. Não foram observadas diferenças no número de corpos lúteos, estruturas ou embriões recuperados (P > 0,05), mas as taxas de recuperação e o percentual de embriões viáveis diferiram entre os grupos (P < 0,05). A associação da prolificidade da linhagem das matrizes com as características do desenvolvimento somático e resposta superovulatória dos filhotes deve ser considerada no estabelecimento de populações experimentais F1. O uso de animais cruzados, contudo, não reduziu a variabilidade da resposta aos tratamentos hormonais.
Assuntos
Animais , Feminino , Masculino , Camundongos , Gravidez , Animais Recém-Nascidos/crescimento & desenvolvimento , Cruzamentos Genéticos , Embrião de Mamíferos/fisiologia , Desenvolvimento Embrionário/fisiologia , Impressão Genômica/genética , Animais Recém-Nascidos/genética , Desenvolvimento Embrionário/genética , Impressão Genômica/fisiologia , Camundongos Endogâmicos CBARESUMO
OBJECTIVE@#To investigate the application of ITO method and discriminant functions method in full sibling and half sibling identification.@*METHODS@#Five hundred pairs of full siblings (FS), 50 pairs of half siblings (HS) and 500 pairs of unrelated individuals (UR) were genotyped by PowerPlex 16 system. Full sibling index (FSI), half sibling index (HSI) and the FSI:HSI ratio were calculated with ITO method. Allelic matching of each pair of the three groups was compared. The locus numbers of no-allele sharing (x0), half-allele sharing (x1) and two-alleles sharing (x2) were calculated, respectively. The discriminant functions about full-siblings, half-siblings and unrelated individuals (UR) were established by SPSS 13.0 statistical software.@*RESULTS@#(1) Regard FSI > or = 19 or FSI < 1 as the standard of distinguishing full sibling from unrelated individual, the alternate correct percentage was 96.4%. Regard HSI > or = 19 or HSI < 1 as the standard of distinguishing half sibling from unrelated individual, the alternate correct percentage was 85.3%. Regard FSI:HSI > or = 1 or FSI:HSI < 1 as the standard of distinguishing full sibling from half sibling, the alternate correct percentage was 87.5%. (2) Four groups of discriminant functions were established. The alternate correct percentage of these discriminant functions were 84.4%-97.7%, with the highest one in full sibship-unrelated individual group.@*CONCLUSION@#Both ITO method and discriminant functions method are efficient in identification of full sibling or half sibling.
Assuntos
Humanos , Alelos , Análise Discriminante , Genética Forense , Variação Genética , Impressão Genômica/genética , Genótipo , Paternidade , Irmãos , Sequências de Repetição em Tandem/genéticaAssuntos
Animais , Feminino , Impressão Genômica/genética , Humanos , Masculino , Mitocôndrias/genética , Partenogênese/fisiologiaRESUMO
Los síndromes de Angelman y Prader-Willi son desórdenes del neurocomportamiento con manifestaciones clínicas diferentes y constituyen el mejor ejemplo del concepto de impronta genómica. Se encuentran asociados con deficiencias maternas y paternas de una misma región en el cromosoma 15q11-q13, respectivamente. Los pacientes con síndrome de Prader-Willi presentan hipotonía muscular al nacimiento, obesidad, talla baja, retraso psicomotor e hipogonadismo; la facies es peculiar. El síndrome de Angelman se caracteriza por microbraquicefalia, pelo delgado y claro, hipoplasia maxilar, ojos hundidos, boca grande con protrusión lingual y prognatismo; el retraso psicomotor es severo, neurológicamente presentan ataxia, movimientos como ®marioneta¼ y ausencia del lenguaje; la mayoría de los pacientes presenta convulsiones, electroencefalograma anormal y paroxismos de risa. El pronóstico de ambas enfermedades es bueno si se evitan las complicaciones
Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Pré-Escolar , Cromossomos Humanos Par 15/genética , Impressão Genômica/genética , Síndrome de Angelman/diagnóstico , Síndrome de Angelman/terapia , Síndrome de Prader-Willi/diagnóstico , Síndrome de Prader-Willi/genética , Síndrome de Prader-Willi/terapiaRESUMO
Genomic imprinting is a new concept proposed to explain unusual observations in early mammalian development, the occurrence of certain genetic diseases, genetic anticipation or incomplete penetrance, and tumorigenesis. The basic mechanism of the imprinting has remained obscure, although DNA-methylation, chromatin structure, and/or DNA replication may have a role. Genomic imprinting is a biological phenomenon determined by an evolutionally acquired, underlying system that may control harmonious development and growth in mammals. It is also relevant to the occurrence of some genetic disorders in man.